中山大学肿瘤防治中心从1989年7月在肿瘤内科开设儿童肿瘤化疗专业,是国内首家设立儿童肿瘤化疗专业的肿瘤医院。2002年在肿瘤内科开设儿童肿瘤化疗病区。2010年1月7日,成立儿童肿瘤科。儿童肿瘤科是广东省抗癌协会小儿肿瘤专业委员会前任主任委员单位、中国抗癌协会小儿肿瘤专业委员会常委单位。牵头制定过年CSCO淋巴瘤诊疗指南、髓母细胞瘤诊疗指南等。

儿童肿瘤科主要收治18岁以下儿童青少年恶性肿瘤，以化疗为主并与外科和放疗科等学科联合对儿童肿瘤患者进行多学科综合诊治。主要病种包括恶性淋巴瘤、白血病、神经母细胞瘤、肾母细胞瘤、肝母细胞瘤、中枢神经系统肿瘤、骨和软组织肉瘤、尤文氏肉瘤/原始神经外胚叶肿瘤、生殖系统肿瘤、郎罕氏组织细胞增生症和视网膜母细胞瘤等恶性肿瘤。

儿童肿瘤科在儿童肿瘤诊治方面经验丰富，治疗规范，实体肿瘤综合治疗技术力量雄厚。治疗方案与国外发达国家接轨。